Los números monográficos son, como su propio nombre indica, ediciones especiales del Todo Por Hacer enfocadas al análisis de un único tema. La razón por la cual se le decide conceder esa importancia a una única cuestión puede deberse a una amplia variedad de razones que van desde su incidencia en el contexto social, político y/o económico en el que se desarrollan – como puede ser en el caso de una gran reforma legislativa, por ejemplo – hasta la propia importancia abstracta o teórica que pueda ostentar ese tema, aunque no se corresponda con una gran relevancia mediática o social. A pesar de que estos números «especiales» son monográficos y no periódicos, en esencia son lo mismo que los números mensuales de Todo Por Hacer, en el sentido de que se tratan de una herramienta de difusión de unas ideas que han sido sometidas a debate en una asamblea horizontal, plasmadas sobre el papel y que cuentan con las mismas ventajas y limitaciones.